Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms