Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms