Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
NEUROD1Q13562 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms