Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CHRNEQ04844 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms