Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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PGGT1BP53609 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP53609 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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