Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COPS7AQ9UBW8 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms