Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms