Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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LAMA3Q16787 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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LAMA3Q16787 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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LAMA3Q16787 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LAMA3Q16787 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
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LAMA3Q16787 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
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LAMA3Q16787 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LAMA3Q16787 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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