Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDKN3Q16667 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms