Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BRD3Q15059 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms