Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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CHD4Q14839 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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CHD4Q14839 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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CHD4Q14839 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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CHD4Q14839 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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CHD4Q14839 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHD4Q14839 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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