Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RUNX3Q13761 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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