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| RUNX3 | Q13761 | AC010285.3-201 | ENST00000511668 | 676 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000926.4-201 | ENST00000527351 | 454 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYPA-211 | ENST00000535709 | 695 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087897.1-201 | ENST00000550134 | 156 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL132857.1-201 | ENST00000555180 | 708 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012170.3-201 | ENST00000560159 | 297 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009019.1-202 | ENST00000568410 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023824.3-201 | ENST00000569003 | 562 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026620.1-201 | ENST00000584815 | 326 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087749.1-202 | ENST00000585020 | 566 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01255-206 | ENST00000591431 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012493.2-201 | ENST00000595083 | 291 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-222 | ENST00000600177 | 751 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC073387.2-201 | ENST00000604797 | 784 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL450336.1-201 | ENST00000605180 | 586 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC097520.1-201 | ENST00000624435 | 385 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02086-205 | ENST00000628749 | 679 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MCF2-203 | ENST00000370576 | 3688 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KBTBD3-207 | ENST00000534815 | 3396 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCL1-203 | ENST00000437704 | 5979 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EMSY-210 | ENST00000529032 | 6848 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ALG6-201 | ENST00000263440 | 1895 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079160.1-202 | ENST00000508406 | 2795 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf34-202 | ENST00000337103 | 3652 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2D3-233 | ENST00000618836 | 3472 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SULT1B1-201 | ENST00000310613 | 7115 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NMD3P1-201 | ENST00000439704 | 1488 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ASAH2-201 | ENST00000329428 | 2184 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104662.3-202 | ENST00000507794 | 4055 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1339P-201 | ENST00000363574 | 91 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-353P-201 | ENST00000364266 | 108 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TUBD1-204 | ENST00000376094 | 1154 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP22-2-201 | ENST00000382830 | 293 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR128-1-201 | ENST00000384921 | 82 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR92A2-201 | ENST00000385299 | 75 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM60P5Y-201 | ENST00000413946 | 574 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL39L-202 | ENST00000433055 | 749 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OPA1-AS1-201 | ENST00000433105 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031663.1-201 | ENST00000437445 | 219 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091862.1-201 | ENST00000438016 | 1100 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPANXN4-202 | ENST00000446864 | 431 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC135371.1-201 | ENST00000446964 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031313.1-201 | ENST00000448435 | 256 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012355.1-201 | ENST00000450290 | 769 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAJC19P8-201 | ENST00000452887 | 259 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354710.1-201 | ENST00000453641 | 246 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC244505.3-201 | ENST00000454598 | 187 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026355.2-201 | ENST00000456755 | 723 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139824.2-201 | ENST00000458731 | 1095 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL594P-201 | ENST00000470590 | 287 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO3P35-201 | ENST00000485582 | 781 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC025445.1-201 | ENST00000502728 | 300 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC011405.1-201 | ENST00000514207 | 248 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RNU6-1028P-201 | ENST00000517164 | 93 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGKV2-36-201 | ENST00000519999 | 223 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108863.1-201 | ENST00000520863 | 650 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC117834.1-202 | ENST00000521203 | 561 nt | TSL 4 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10V3P-201 | ENST00000525712 | 725 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IFNG-AS1-201 | ENST00000536914 | 494 nt | TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2NP1-201 | ENST00000545592 | 458 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP23-201 | ENST00000558717 | 1102 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018554.1-201 | ENST00000565506 | 800 nt | TSL 2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLKP1-201 | ENST00000595979 | 403 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024060.1-201 | ENST00000607052 | 494 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLG2-AS1_1.1-201 | ENST00000622319 | 213 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX649567.1-201 | ENST00000642071 | 1134 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MGA-201 | ENST00000219905 | 12042 nt | APPRIS P4 TSL 5 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPZ1-201 | ENST00000296739 | 1868 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMP5-201 | ENST00000370830 | 3952 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MFSD8-233 | ENST00000641482 | 4860 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BAZ2B-204 | ENST00000392783 | 8289 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCO1P6-201 | ENST00000481192 | 1384 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAH12-202 | ENST00000351747 | 9542 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPPA3-201 | ENST00000345088 | 1079 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P27-201 | ENST00000403775 | 720 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQCA1-AS1-201 | ENST00000413353 | 489 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592310.1-201 | ENST00000414330 | 671 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIPT1P1-201 | ENST00000415870 | 1186 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC017079.2-201 | ENST00000416102 | 485 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4K6P-201 | ENST00000416478 | 897 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100848.1-201 | ENST00000417298 | 637 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GRM7-AS1-201 | ENST00000420230 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1DP1-201 | ENST00000426049 | 402 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092634.2-201 | ENST00000428146 | 1010 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL512649.1-201 | ENST00000428997 | 581 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPEF1-AS1-201 | ENST00000430641 | 430 nt | TSL 5 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTATP6P17-201 | ENST00000431030 | 672 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359878.2-201 | ENST00000435531 | 407 nt | TSL 3 BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGB1P45-201 | ENST00000435986 | 653 nt | BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |