Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CDH18Q13634 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms