Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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