Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms