Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
TRIM28Q13263 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TRIM28Q13263 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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