Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IFT88Q13099 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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