Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TRAF1Q13077 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAF1Q13077 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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