Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
STRN3Q13033 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.3 ms