Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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PTPRAP18433 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRAP18433 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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