Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TIMMDC1Q9NPL8 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms