Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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FOXQ1Q9C009 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXQ1Q9C009 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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