Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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UBXN4Q92575 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
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UBXN4Q92575 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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UBXN4Q92575 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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UBXN4Q92575 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
UBXN4Q92575 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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