Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL24A1Q17RW2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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COL24A1Q17RW2 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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COL24A1Q17RW2 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL24A1Q17RW2 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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