Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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RTL8BQ17RB0 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RTL8BQ17RB0 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RTL8BQ17RB0 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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