Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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GRIK4Q16099 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
GRIK4Q16099 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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