Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SYCP1Q15431 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms