Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PUM3Q15397 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms