Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDCD1Q15116 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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