Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SMCO1Q147U7 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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