Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
EXOSC2Q13868 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms