Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ATP1A4Q13733 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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