Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
NEUROD1Q13562 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms