Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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