Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
CHD3Q12873 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHD3Q12873 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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