Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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HOXD10P28358 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HOXD10P28358 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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