Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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