Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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RPE65Q16518 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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