Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC85BQ15834 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms