Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HMGN3Q15651 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms