Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
BRD3Q15059 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms