Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL4A6Q14031 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms