Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CACNA1SQ13698 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CACNA1SQ13698 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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