Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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