Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SGCGQ13326 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms