Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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IFT88Q13099 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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IFT88Q13099 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IFT88Q13099 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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