Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
BPTFQ12830 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms