Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TSPOP30536 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TSPOP30536 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms