Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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HOXD10P28358 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HOXD10P28358 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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