Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HLA-DQB1P01920 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms