Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Q1T7F1 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms